Здравствуйте. Искать надо от генератора, раз уж все случилось после его ремонта. Проверьте напряжение в бортовой сети в момент пропадания тяги. Проверьте надежность крепления силовых клемм - как плюсовой, так и минусовой. Возможно, что где-то пропадает контакт и идет скачок напряжения. После чего, электроника просто глушит двигатель. Возможно, что придется вскрывать и проверять генератор.