Скорее всего, при затяжке гайки без снятия троса вы создали избыточное плечо силы, которое привело к механическому смещению или деформации. Поскольку без троса переключения на самой коробке идут плавно, проблема кроется в нарушении соосности между рычагом селектора и датчиком положения (ингибитором).
Когда вы тянули гайку, трос сработал как жесткий упор: в лучшем случае вы просто сдвинули корпус датчика в пределах крепежных пазов, в худшем - слегка подогнули шток выбора передач или сам кронштейн крепления троса.
Тугое включение режима D и недоход до положения P (когда остается R) - классический признак того, что рабочая длина троса теперь не соответствует ходу рычага в салоне.
Трос физически «не дотягивает» механизм до нужной точки. Чтобы это исправить, нужно заново откалибровать систему. Сначала переведите селектор в салоне в нейтраль и убедитесь, что метки на датчике АКПП совпадают (на корпусе и вращающейся части обычно есть пропилы или отверстия под фиксатор).
Если метки на месте, ослабьте фиксатор троса, установите рычаг на коробке и селектор в салоне строго в положение P, после чего затяните крепление троса в свободном состоянии.
Если же регулировка не поможет, внимательно осмотрите кронштейн на предмет изгиба - даже деформация в пару миллиметров дает именно такие симптомы.